毕家在各地设立的交子铺被迫关门歇业。而肖家却不愿失去赚钱机会，秘密私印交子，因担心被官府查办，竟以毕家名义设立地下交子铺。毕家因此遭来横祸，官府查封了毕家所有印坊，国子监不问青红皂白，将毕家的木活字技术视为魔鬼邪术，责令取缔。

毕昇被打入牢房，毕母因此旧病复发，不久阔别人世，毕家笼罩在悲伤的气氛中。

毕顺认为毕家不能没有毕昇，于是挺身而出，将责任独揽其身，顶替了毕昇的罪名，不久，毕顺便因病死于狱中。

同年，朝廷书库发生火灾，皇帝下令，从各州县印坊中召集高手重印国书。毕昇认为这是让木活字重见光明的大好时机，于是决定前往京城推广自己的木活字技术，贤妻李妙音非常支持毕昇的做法，遗憾的是，因毕家犯有前科，毕昇被国子监拒之门外。

此时，肖家也接到国子监下派任务，让肖家印坊坊主肖翔进京雕印国书，肖翔自知技不如人，且不愿意受累，于是疏通关系，让毕昇顶替了肖家的名额。

毕昇如愿以偿，与儿子毕嘉和毕成一道，带着自己的木活字宝贝踏上了前往京城的路。

毕昇到达京城后，大肆推广木活字应刷术，京城八大印坊坊主虽承认木活字的高效率和优越性，但由于国子监已禁止毕家印刷术推行，坊主们均不敢贸然使用木活字。毕昇声称一切后果由他来承担，加上就读于国子监的高丽生员朴成哲的劝说，坊主们方才勉强地接受了木活字，然而皆只能偷偷印制。

坊主们采用木活字技术，不到一年时间便完成了国书的印制任务，宰相寇准甚为诧异，得知实情后，立刻召见了毕昇，打算在全国范围内推行毕昇的木活字技术。毕昇的愿望终于实现，正当毕昇打算派手下将这一喜讯告诉远在蕲州老家的妻子时，一件意想不到的事情发生了。

宋真宗在审阅国书时，发现偶有缺字少笔画的现象，十分不悦。毕昇细查缘由，方知由于来自日本和欧洲的国子监生员暗中偷走木活字，师傅们不得不临时刻字补缺，然而，由于补缺的字材料有差异，导致印版高低不平，所以印书才出现缺字少笔画的现象。宰相王钦若则认为毕昇未经国子监允许私自推行技术不成熟的木活字，因此造成巨大损失，于是将毕昇打入死牢。宰相寇准竭力为毕昇开脱，暂且保住毕昇性命，待国书印制完工后再作商议。