据不完全统计，目前在北京，副省级以上单位的驻京办有52家，市级单位驻京办520家，县级单位驻京办5000余家。如果加上各级(主要是省)政府职能部门及各类开发区管委会设的联络处(或办事处)、各种协会、国有企业和大学的联络处，各种驻京机构超过1万家。

而高层信息显示，此次方案仅对省、自治区、直辖市、计划单列市、副省级市人民政府驻北京办事处，新疆生产建设兵团驻北京办事处，经济特区人民政府驻北京办事处，予以保留。已经设立的地级市、地区、盟、州人民政府驻京联络处，确因工作需要，经所在省(区、市)人民政府核准后，方可保留。

也就是说，将有数千家“保留”之外的驻京办面临被撤销的命运，时限是“6个月内完成”，届时各省(区、市)人民政府要将有关情况报送国务院。

北京大学政府管理学院李成言教授对本刊记者说：“被撤销的驻京办，不能以任何名义和任何形式在北京设立新的办事机构，或者派驻人员以驻京办事机构名义开展活动。地方各级政府及其部门、地方各级机构编制管理和财政部门不得为违规设立的驻京办事机构审批编制、核拨经费。一旦违反规定要严肃处理，并追究有关人员的责任。”

国家行政学院公共行政教研室主任竹立家教授表示，很多县级的驻京办变成了接待站，背离了驻京办应有的主要职能。“由于县级单位的工作协调关系，主要集中在地市一级和省一级，其与中央各部委之间直接发生的关系并不多。让它们在6个月内撤销，应该说时间还是很宽裕的。”

近年来，驻京办存在的腐败问题和种种违规行为，引起了中央高层的关注。2006年，调查整顿驻京机构被中纪委列为重点任务之一。

2006年1月5日，中共中央政治局常委、中央纪委书记吴官正在中央纪委第六次全会上明确指出，要“防止和解决一些地方和企业驻京办事机构存在的请客送礼等不正之风”。

2006年2月27日，国务院机关事务管理局(下称国管局)召开廉政工作会议，各省驻京办负责人参加。会议决定，由中纪委负责调研驻京办，由国管局具体酝酿拿出改革方案并择机公布。

2006年11月，国管局官方网站发布调研报告，提出对52家副省级以上政府办事处和大型国企驻京办事处的整顿与改革思路。

2007年初，中共中央政治局常委、中央纪委书记吴官正在中纪委第七次全体会议上，三次提到了驻京办的腐败问题，要求纪检监察部门协助有关部门整顿和规范地方党政机关及国有企业驻京办事机构，认真开展专项清理，切实加强监管。